Ресурсный центр «Магнитно-резонансные методы исследования»

T. Kozlecki, P.M. Tolstoy, A. Kwocz, M.A. Vovk, A. Kochel, I. Polowczyka, P.Yu. Tretyakov, A. Filarowski

“Conformational state of β-hydroxynaphthylamides and barriers for the rotation of the amide group”

Spectrochimica Acta, Part A, 2015, accepted

Three β-hydroxynaphthylamides (morpholine, pyrrolidine and dimethylamine derivatives) have been synthesized and their conformational state was analysed by NMR, X-ray and DFT calculations. In aprotic solution the molecules contain intramolecular OHO hydrogen bonds, which change into intermolecular ones in solid state. The energy barriers for the amide group rotation around the CN bond were estimated from the line shape analysis of 1H and 13C NMR signals. A tentative correlation between the barrier height and the strength of OHO bond was proposed. Calculations of the potential energy profiles for the rotations around CC and CN bonds were done. In case of morpholine derivative experimental indications of additional dynamics: chair-chair ‘ring flip’ in combination with the twisting around CC bond were obtained and confirmed by quantum chemistry calculations.

02.12.14 в центре прошел семинар М.А. Вовк (специалист РЦ МРМИ) на тему «Исследование подвижности обратных мицелл методом ЯМР: коэффициенты диффузии и корреляции между ними»

M. Popova, D. Michel

“Behavior of Sodium Lauroyl Sarcosinate in Solution and Binary Mixtures by Means NMR”

Applied Magnetic Resonance 2014, 45, 353-364

DOI 10.1007/s00723-014-0531-9

Measurements of the ¹H and ¹³C chemical shifts as well as ¹H spin–lattice relaxation times of sodium lauroyl sarcosinate (SLAS) in aqueous solutions and mixed binary systems with co-surfactants were carried out at various concentrations. It will be shown that changes in the chemical shifts for the N–CH₂ groups in SLAS with increasing surfactant concentration can be used to estimate the ratio p_cis /p_trans of cis– and trans-isomers. The relative fraction p trans of molecules in trans-configurations increases the most in a narrow concentration range 0.007–0.034 mol/l, i.e., at the transition from the monomeric state to the micelle. The ratio p_cis /p_trans asymptotically decreases with increasing concentration, reaching a constant value at concentrations significantly above the critical micelle concentration. Thus, the ratio can be related to the process of micellization. If micellization takes place, the cis-isomer starts to transform into trans-isomer because the trans-isomer is more favorable in micelles. Because of the smaller cross section of the polar group region, the trans-conformation can be more easily incorporated into the micelle. In summary, the occurrence of micellar aggregates at low SLAS concentration in mixed systems can be clearly inferred from the nuclear magnetic resonance spectra.

Сотрудники РЦ приняли участие в конференции Central European School on Physical Organic Chemistry, прошедшей в г. Пшесека (Польша) 26-30.05.2014.

Был представлен пленарный доклад

P.M. Tolstoy, S.A. Pylaeva, B. Koeppe, E.Yu. Tupikina, C. Allolio, D. Sebastiani, G.S. Denisov, H.-H. Limbach
«Aprotic Polar Solvent Dynamics and Proton Tautomerism in Strong Hydrogen Bonds. NMR, UV-vis and MD Study»

и постерная презентация

M.A. Vovk, A. Kwocz, T. Kozlecki, P. Tretyakov, P.M. Tolstoy, A. Filarowski
«NMR study of hindered internal rotation in β-hydroxynaphthylamides».

В РЦ был записан первый 3D ЯМР спектр HNCO однородно меченного изотопами ¹³C и ¹⁵N белка убиквитин для новой Лаборатории биомолекулярного ЯМР под руководством Н. Р. Скрынникова. Сотрудники Лаборатории особо благодарят специалиста РЦ МРМИ М. А. Вовка.

Михаил Вовк и Севастьян Рабдано рассказали о стратегиях определения структуры белков методами ЯМР.

Сотрудники РЦ Михаил Вовк и Севастьян Рабдано прошли обучение в Швейцарии на курсах по методам ЯМР для изучения меченых белков и получили сертификаты.

Сотрудники РЦ представили постерные доклады на кластере конференций по органической химии «ОргХим-2013», прошедшей в Репино 17-21.06.2013.

• Е.Ю. Тупикина, П.М. Толстой, Г.С. Денисов, «Изменение геометири 1,1-динитроэтана при переходе CH-протона к различным основаниям в комплексах с водородной связью C-H…B»
• А.А. Гуринов, И.Г. Шендерович, A. Zukal, J. Cejka, «Исследование кислотных центров на поверхности мезопористых кремнеземов методом ЯМР спектроскопии»
• М.А. Вовк, М.С. Павлова, В.И. Чижик, «Расчет констант квадрупольной связи для кластеров CH₃COO- * N H₂O (N > 24) методом квантовой химии»
• С.О. Рабдано, А.В. Донец, «Свойства гидратации отдельных функциональных групп органических молекул»